Bakteerien tieteellisistä nimistä ensimmäinen osa kirjoitetaan isolla alkukirjaimella, jälkimmäinen osa pienellä:
Bacillus anthracis perunaruttoa aiheuttava bakteeri
Yleiskieliset bakteerien nimet kirjoitetaan pienellä alkukirjaimella:
kolibakteeri
kampylobakteeri
Bakteerien tieteelliset nimet kirjoitetaan niin kuin kasvien ja eläinten tieteelliset nimet: kaksiosaisen nimen ensimmäinen osa eli suku kirjoitetaan isolla alkukirjaimella ja jälkimmäinen osa eli laji pienellä alkukirjaimella.
Bakteerien yleiskieliset nimet taas kirjoitetaan pienellä alkukirjaimella. Esimerkiksi tieteellisen nimen Staphylococcus aureus suomeen mukautettu yleisnimi on stafylokokki.
Haemophilus influenzae eräs hemofilusbakteeri
Legionella pneumophila legioonalaistautia aiheuttava bakteeri
Listeria monocytogenes listerioosia aiheuttava bakteeri
Helicobacter pylori eräs helikobakteeri
Corynebacterium diphtheriae kurkkumätää aiheuttava korynebakteeri
Tieteellinen nimi kirjoitetaan kokonaisena, kun se mainitaan tekstissä ensimmäistä kertaa tai kun samasta suvusta on lueteltuna monta lajia. Sen jälkeen bakteeriin voidaan viitata käyttämällä vain suvun isoa alkukirjainta ja pistettä ja lajinimeä, esimerkiksi B. anthracis. Luonnontieteellisessä tekstissä tieteelliset nimet on tapana kursivoida.